Фомопсис подсолнечника является одним из наиболее вредоносных интенсивно распространяющихся заболеваний подсолнечника в мире. Потери урожая при заражении растений могут достигать до 50%.

На сегодняшний день фомопсис подсолнечника зарегистрирован в 31 районе Воронежской области (Аннинский, Бобровский, Богучарский, Борисоглебский, Бутурлиновский, Верхнемамонский и др.). Площадь установленной карантинной зоны составляет  39683 га.

Специалистами Управления в карантинных зонах проводятся контрольные обследования и мониторинг, образцы направляются для проведения экспертизы в ФГБУ «ВНИИКР».

Выполнение  сельхозтоваропроизводителями мероприятий по борьбе с карантинным заболеванием находится на контроле Управления.

В 2017 году в Воронежской области упразднены фитосанитарные карантинные зоны по фомопсису подсолнечника на 3667 га.