Россельхознадзор сообщает данные о генетических характеристиках изолята A/chicken/Primorsky/0085/2008 высокопатогенного гриппа А птиц, выделенного в Приморском крае.

Проведен сравнительный анализ последовательностей фрагментов генов HA (H5), NA (N1), MP и NP (длиной 319, 297, 402 и 296 н., соответственно).

Результаты анализа показали, что изолят A/Russia/Primorsky/0085/2008 при-надлежит азиатской генетической линии вируса высокопатогенного гриппа птиц типа А (линия A/Guandong/1/96). В то же время, первичная последовательность изолята A/Russia/Primorsky/0085/2008 заметно отличается от сублинии Qinghai, ранее встречавшейся на территории РФ.

По фрагменту гена НА изолят A/Russia/Primorsky/0085/2008 наиболее близок к: A/Ph/ST/44/2004 (AY651366), A/duck/Hunan/1652/2005 (DQ320913), A/duck/Hunan/1608/2005 (DQ320912), A/duck/Hunan/1265/2005 (DQ320911) (различия 2,2%).
Различия с ранее выявленными российскими изолятами сублинии Qinghai составляют 5,5-6,2%.
Фрагмент гена HA

По фрагменту гена NA (N1) изолят A/Russia/Primorsky/0085/2008 наиболее близок к: A/magpie robin/Hong Kong/366/2006 (EF124201) A/chicken/Hong Kong/282/2006 (EF124200) (различия 2,4%).
Отличия от изолятов сублинии Qinghai по фрагменту гена NA составляют 4,5-5,6%.
Фрагмент гена NA

По фрагменту гена MP отмечено совпадение (различие 0,5%) с большой группой последовательностей из Китая и Юго-Восточной Азии: A/Muscovy duck/Vietnam/39/2007 (CY029674), A/duck/Hunan/733/2004 (CY029324), A/duck/Hunan/533/2004 (CY029317), A/Chicken/Laos/Xaythiani 37/2006 (EU124191) и др.).
Фрагмент гена MP

По фрагменту гена NP сходство с опубликованными последовательностями также было 99.7% A/human/China/GD02/2006 (EU263985), A/Shenzhen/406H/2006 (EF137709), A/chicken/Guiyang/1655/2006 (EF124478) и др.)
Фрагмент гена NP

Таким образом установлено, что исследуемый изолят A/chicken/Primorsky/0085/2008 принадлежит к азиатской генетической линии вируса высокопатогенного гриппа птиц типа А (линия A/Guandong/1/96), но значительно отличатся от изолятов вируса гриппа птиц, выделенных на территории Российской Федерации в 2005-2007г. Эти данные свидетельствует о том, что причиной вспышки заболевания домашних кур в с. Воздвиженка (Приморский край, Уссурийский район) является новый занос вируса на территорию Российской Федерации.