Еще в марте 2019 года при проведении плановой выездной проверки в отношении этой организации был установлен факт зарастания сорной растительностью принадлежащего ей участка площадью 133 га, расположенного на территории Пречистенского сельсовета Измалковского района Липецкой области. Тогда ведомство выдало предписание об устранении выявленного нарушения требований земельного законодательства со сроком исполнения до октября 2019 года. Однако в установленный срок оно не было выполнено. Постановлением мирового судьи Лев-Толстовского судебного участка Чаплыгинского судебного района Липецкой области, вынесенным в ноябре 2019 года, ООО "Черкизово-Свиноводство" было привлечено к административной ответственности по ч.25 ст. 19.5 КоАП РФ (неисполнение в срок законного предписания) с назначением штрафа в размере 200 000 рублей. 15 января 2020 года Чаплыгинский районный суд оставил в силе постановление мирового судьи. Штраф был оплачен.
Кроме того, было выдано новое предписание со сроком исполнения до мая 2020 года. По ходатайству юридического лица срок его исполнения продлен до 30 апреля 2021 года в связи со сложной эпидемиологической обстановкой по COVID-19. В итоге данное предписание было выполнено, предприняты исчерпывающие меры по вовлечению участка в сельхозоборот. Земли были сданы в аренду ИП главе КФХ Штукатурову С.А., силами которого проведены агротехнические, агрохимические, фитосанитарные мероприятия по воспроизводству их плодородия. На момент проверки ведомства на участке высеян подсолнечник под урожай 2021 года.
Кроме того, в рамках исполнения предписания в 2021 году федеральным государственным бюджетным учреждением «САС «Елецкая» будет проведено агрохимическое и эколого-токсикологическое обследование данного земельного участка.
