Анализ рисков и разработка методов контроля спермопродукции проводится как отечественными, так и иностранными авторами. Среди возбудителей инфекционных болезней крупного рогатого скота, влияющих на фертильность быков, наиболее часто в литературных источниках упоминаются бактерии рода Campylobacter.

Ранее показано, что эти бактерии способны необратимо связываться со сперматозоидами, изменяя структуру и функциональность плазматической мембраны сперматозоидов, что негативно влияет на качество спермы быков. При этом в нашей стране изучение кампилобактерий разных видов, встречающихся в репродуктивном тракте быков, из-за сложностей, связанных с культивированием этих микроорганизмов, проводят достаточно редко. Появление технологий секвенирования нового поколения позволяет проводить оценку наличия в образце различных, в том числе плохо культивируемых, микроорганизмов и дает новую информацию о представленности разных бактерий в микробиоме.

Исследования 34 образцов криоконсервированной спермы быков проводили с использованием технологии секвенирования нового поколения на платформе IlluminaMiseq. Биоинформатический анализ осуществляли с использованием программного обеспечения Illumina «Metagenomics 16S rRNA» и также пакета программ QIIME2.

В образцах спермы быков было определено присутствие генетического материала 15 различных родов бактерий. Последовательности микроорганизмов рода Campylobacter были выявлены в 76,5% образцов. При этом для спермы быков из российских хозяйств Campylobacter был третьим по частоте родом, встречающимся в большинстве образцов. Содержание нуклеотидных последовательностей Campylobacter варьировало у разных быков от 5,99 до 1049,68%. Анализ полученных фрагментов генома позволил идентифицировать вид Campylobacterureolyticus. Данный вид был определен также в 20 из 24 образцов спермы из иностранных племенных центров. Содержание фрагментов ДНК этого микроорганизма варьировало в разных образцах от иностранных быков от 1,55 до 23,7%.

Проведенный в работе анализ встречаемости и сочетаний микроорганизмов в сперме быков с удовлетворительными и неудовлетворительными показателями качества семени показал, что представители рода Campylobacter часто встречаются в образцах, характеризующихся аномальными показателями спермограммы. Требуется проведение дополнительных исследований, которые смогут показать корреляцию встречаемости определенных таксонов микроорганизмов с показателями качества спермопродукции, что позволит повысить успешность искусственного осеменения.