В 1 полугодии 2013 года территориальными управлениями Россельхознадзора совместно с подведомственными федеральными государственными бюджетными учреждениями в целях контроля за сохранением плодородия и выявления загрязнения земель сельскохозяйственного назначения опасными химическими веществами, патогенами и экопатогенами было отобрано 9,7 тыс. почвенных образцов, в том числе на агрохимические показатели 5,9 тыс. образцов с площади 90 тыс. га, на химико-токсикологические показатели — 4,5 тыс. образцов с площади 24,9 тыс. га. Снижение плодородия почв было выявлено на площади 16 тыс. га, загрязнение почв опасными химическими веществами выявлено на площади 3,3 тыс. га.

Наибольшее количество случаев загрязнения выявлено солями тяжелых металлов — 336 случаев (цинк, свинец, мышьяк и пр.), по микробиологическим показателям — 292 случая (энтерококки, бактерии группы кишечной палочки, яйца гельминтов и пр.) и превышение предельно допустимой концентрации нитратного азота — 251 случай. Также выявлено 186 случаев загрязнения почвы нефтепродуктами, которые произошли в результате прорывов нефтепроводов. Превышение содержания остаточных количеств пестицидов в почве выявлено в 66 образцах.