Серьезную озабоченность Россельхознадзора вызывает то обстоятельство, что значительная часть поступающих на территорию Таможенного пространства подкарантинных грузов не проходит соответствующей проверки. Так, с 15 по 25 ноября при проведении Россельхознадзором внутреннего мониторинга, выявлено 86 транспортных средств с ненарушенными пломбами стран-поставщиков, что свидетельствует о том, что находившийся в них груз не проверялся при пересечении государственной границы Белоруссии. При этом в пяти транспортных средствах обнаружено заражение срезанных цветов хризантем и роз цветочным трипсом и табачной белокрылкой». Переговоры направлены на снижение рисков заноса карантинных объектов на территорию стран-участниц Таможенного союза.

При этом Россельхознадзор считает необходимым отметить, что появившаяся в средствах массовой информации цифра об ущербе от возможного проникновения наиболее опасных карантинных объектов на территорию России в 480 млрд. рублей носит оценочный характер и основана на соответствующих расчетах экспертов РАСХН и не отражает реальных потерь, существующих в настоящее время в связи с ослаблением фитосанитарного контроля на границе Таможенного союза.