22 января 1898 года Министерством внутренних дел в соответствии с решением Его Императорского Величества Николая II была создана Санкт-Петербургская ветеринарная лаборатория.

В 2005 году ФГБУ «Ленинградская МВЛ» поступило в ведении Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору Министерства сельского хозяйства Российской Федерации.

Благодаря непосредственному участию Руководителя службы Сергея Алексеевича Данкверта в становлении и развитии лаборатории, на сегодняшний день – это уникальное многопрофильное исследовательское Учреждение.

В 2016 году ФГБУ «Ленинградская МВЛ» награждена премией «Серебряный моль», как лучшая аккредитованная лаборатория.