В 2011 году у Россельхознадзора были частично изъяты и в прежнем объеме не переданы ни одному из надзорных органов полномочия по контролю за обращением пестицидов и агрохимикатов. Тему опасности для окружающей среды и здоровья человека бесконтрольного перемещения, хранения, использования таких веществ сотрудники Россельхознадзора начали поднимать практически сразу, когда пришло понимание, что процесс обращения пестицидов и агрохимикатов становится неконтролируемым. Ранее должностными лицами Россельхознадзора проводилась существенная работа по надзору за соблюдением правил производства, хранения, применения, транспортировки и реализации пестицидов и агрохимикатов, осуществлялся контроль за утилизацией и захоронением опасных отходов на предприятиях сельского и лесного хозяйства, в коммунальных и садово-парковых хозяйствах, а также за деятельностью организаций, оказывающих услуги по обеззараживанию и фумигации. Была создана и постоянно обновлялась база данных учета организаций, имеющих складские помещения, предназначенные для хранения пестицидов и агрохимикатов, а также занимающихся утилизацией и обезвреживанием непригодных препаратов. Структурные подразделения Россельхознадзора контролировали импортную и отечественную растительную продукцию в части содержания в ней пестицидов, нитратов и нитритов. Неоднократно выявлялись контрафактные и фальсифицированные препараты, главным образом, китайского производства, которые были ввезены незаконным путем и использовались фермерами для выращивания сельхозпродукции без учета каких-либо норм. Зачастую такие препараты хранились с грубыми нарушениями.

На сегодняшний день все эти и ряд других вопросов, касающихся обращения пестицидов и агрохимикатов, остаются нерешенными, однако 29 января 2015 года Государственная Дума РФ рассмотрела законодательную инициативу Законодательного собрания Ленинградской области по внесению в ГД ФС РФ проекта федерального закона «О внесении изменения в статью 15 Федерального закона «О безопасном обращении с пестицидами и агрохимикатами», которым предусматривается возвращение полномочий по контролю за их обращением Россельхознадзору.

В соответствии с процедурой подготовки законопроекта к рассмотрению, он был направлен в различные комитеты, комиссии и инстанции, в том числе в законодательные собрания субъектов РФ для подготовки отзывов, предложений и замечаний. В Законодательном собрании Республики Карелия вопрос о проекте закона рассматривался 12 февраля 2015 года на заседании Комитета по агропромышленной политике и развитию села. Со стороны Управления Россельхознадзора по Республике Карелия, Архангельской области и Ненецкому автономному округу в заседании участвовала начальник отдела пограничного и внутреннего фитосанитарного контроля и надзора Наталья Зинникова. Рекомендации Управления Россельхознадзора были приняты членами комитета к сведению и будут включены в предложения к законопроекту от Законодательного собрания Республики Карелия.